ウェブブラウザ上でRNA-seqデータ解析をする
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ブラウザ上でRNA-seqデータを解析する @ AJACSオンライン14
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ブラウザ上でRNA-seqデータを解析する @ AJACSオンライン14
本日の統合TVは、2022年12月22日に開催された統合データベース講習会:AJACSオンライン14から、大阪大学 免疫学フロンティア研究センター 安水 良明 氏 による「ブラウザ上でRNA-seqデータを解析する」(講習スライド)をお送りします。
本講習では、バルクRNA-seq下流解析ができるようになることを目的として、ウェブブラウザを用いたバルクRNA-seq解析ツールであるiDEPの使い方をハンズオン形式で講習するとともに、類似ツールであるBioJupiesやRaNA-seqについても紹介しています。また、胸腺腫合併重症筋無力症の実データを用いた解析実例も紹介しています。
講習会の一連の動画はYouTubeの再生リストからもご覧いただけます。
本講習では、バルクRNA-seq下流解析ができるようになることを目的として、ウェブブラウザを用いたバルクRNA-seq解析ツールであるiDEPの使い方をハンズオン形式で講習するとともに、類似ツールであるBioJupiesやRaNA-seqについても紹介しています。また、胸腺腫合併重症筋無力症の実データを用いた解析実例も紹介しています。
講習会の一連の動画はYouTubeの再生リストからもご覧いただけます。
Highlights
- 00:15 1. 今日の話の対象となる人
- 03:38 2. Agenda
- 05:13 3. バルクRNAseqとは？
- 11:15 4. バルクRNAseq解析の実際
- 5. ブラウザを用いたバルクRNAseq解析
- 21:21 5-1. iDEP (本日のメイン)
- 01:11:15 5-2. RaNA-seq
- 01:15:16 5-3. BioJupies
- 01:17:32 6. 実例紹介 (重症筋無力症合併胸腺腫の解析)
- 01:28:52 7. まとめ
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230113_AJACSonline14_02_yasumizu.mov