ウェブブラウザ上でRNA-seqデータ解析をする

BioJupiesを使ってウェブブラウザ上でRNA-seqデータ解析を行う

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BioJupiesを使ってウェブブラウザ上でRNA-seqデータ解析を行う

BioJupiesは、マウント・シナイ医科大学の Ma'ayan 研究室で開発・運営されている、ウェブブラウザ上で、RNA-seqデータ解析のJupyter Notebookを作成することができるツールです。データ解析ツールも多数用意されており、オプションを自由に指定することや作成された図を動かしながらデータの解釈をすることができます。また、作成したJupyter Notebookは個別にURLも発行されるので、データの共有や第三者による再現が可能です。
Jupyter Notebook (読み方は「ジュピター・ノートブック」) とは、ノートブックと呼ばれる形式で作成したプログラムを実行し、実行結果を記録しながら、データの分析作業を進めるためのツールのことです。

見どころダイジェスト

  • 01:09 1. データの選択もしくはアップロード
  • 01:23 1.1. Published Dataのアップロード
  • 02:05 1.2. 自身のDataのアップロード
  • 03:31 1.3. Example Dataのアップロード
  • 03:48 2. 解析ツールの選択
  • 05:52 3.結果の閲覧

動画ファイルのダウンロード

190730_biojupies.mov

再利用時のライセンス

クリエイティブ・コモンズ CC-BY-4.0

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