TogoImputation (beta)(旧: NBDC-DDBJインピュテーションサーバ)を使ってSNPアレイデータの遺伝子型推定解析を行う(準備編)

TogoImputation (beta)(旧: NBDC-DDBJインピュテーションサーバ)は、遺伝研スパコンの個人ゲノム解析区画で利用可能なウェブインターフェースです。インピュテーションサーバとは、SNPアレイデータのインピュテーション解析を支援するサービスで、既知の遺伝子型リファレンスパネルを使用して、サンプル内で欠落、もしくは不明瞭な遺伝情報を予測し、補完します。NBDC-DDBJインピュテーションサーバでは、ユーザはThe 1000 Genomes Projectのリファレンスパネルを制限なく利用することができます。また、BioBank JapanプロジェクトおよびThe 1000 Genomes Projectをクロスインピュテーションして得られたリファレンスパネルは申請することで利用可能です。今回はインストールマニュアルを参考にして、NBDC-DDBJインピュテーションサーバを個人ゲノム解析区画で利用できるようにインストールする方法について紹介します。

Highlights

  • 00:07 1. NBDC-DDBJインピュテーションサーバの概要
  • 01:02 2. ヒトゲノム解析区画にログインする
  • 02:35 3. Guacamoleにアクセスする
  • 03:10 4. Guacamoleでインストールの作業を行う
  • 06:31 5. 起動したサーバを確認する

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240526_Imputation_server_install.mov

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