Code Ocean を使って研究の再現に必要なコード、データ、計算環境を共有、発見、実行する

Code Ocean(コード・オーシャン)は、データ解析や分析に必要な様々なコンポーネントを使用者の環境に関わらず再現可能な形式で共有することができるプラットフォームです。研究の再現に必要であるコード、データ、ワークフロー、計算仮想環境などを「Compute capsules」としてセット化して他の研究者が簡便に参照し再利用できるようにしたものです。Compute capsuleはDockerイメージとして使用でき、様々なシステムとの連携が可能です。
Code Oceanに関する以下の講演も合わせてご覧いただくとより理解が深まります。「コード、データ、計算環境をまるごと公開するサービスCode Oceanの紹介 @ Bio”Pack”athon2020#9、#10」

Highlights

  • 00:10 1. Code Oceanの概要
  • 01:08 2. 他の研究者が作ったCompute capsuleを検索/実行する
  • 02:39 3. Compute capsuleを作成する
  • 05:20 4. Code OceanでCompute capsuleを公開する
  • 05:54 5. Code Ocean使用における注意点

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211025_CodeOcean.mov

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