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CLC Genomics Workbench の使い方 変異解析編
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CLC Genomics Workbench の使い方 変異解析編
CLC Genomics Workbenchは、 QIAGEN によって提供されている統合配列解析ソフトウェアです。生命科学データの解析に使われるいろいろなツールを統合されたインターフェースで扱うことができます。今回は、ヒトのゲノムリシーケンスのデータで第20染色体にマップされたリードをデモデータとして、CLC Genomics Workbench (Ver.11) を使った変異解析の方法について紹介します。
Highlights
- 00:28 1. シークエンスデータインポート
- 01:26 2. 参照配列インポート
- 02:58 3. クオリティチェックとトリミング
- 06:29 4. マッピング
- 08:05 5. ローカルリアラインメント
- 09:07 6. 変異検出
- 12:37 7. アミノ酸置換の解析
- 15:36 8. 変異のフィルタリング
- 17:52 9. 遺伝子のアノテーション
- 19:25 10. 3D 構造解析
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180504_clc_snv.mov