AI駆動バイオインフォマティクス研究会

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仮説生成のためのAI readyなゲノムデータ

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仮説生成のためのAI readyなゲノムデータ

AI駆動バイオインフォマティクス研究会 第1回 講演紹介

2026年8月27日に開催された AI駆動バイオインフォマティクス研究会(第1回) における、追川優菜氏による講演 「仮説生成のためのAI readyなゲノムデータ」 をお送りします。本講演では、ファージ設計AIの開発を通じて、仮説生成を行うためにゲノムデータはどのようにAI readyすべきかを議論しています。

目次

  • 0:00 仮説生成のためのAI readyなゲノムデータ
  • 0:24 BacteReason(論文投稿中)
  • 3:25 Agenda
  • 5:22 1. 最新のファージ"設計"AIの問題
  • 8:47 2. 私たちが開発中のファージ設計AI: PhaKit(output, 仮説ツリー)
  • 9:55 3. AIに渡すデータ形式(input)
  • 13:35 ① FASTA→CDS/変異
  • 14:42 ② Gemmaによる仮説候補の選択
  • 16:55 4. このシステムをどう作ったか
  • 19:30 5. まとめ
  • 21:06 質問タイム

見どころダイジェスト

  • 00:00 1. 仮説生成のためのAI readyなゲノムデータ
  • 00:24 2. BacteReason(論文投稿中)
  • 03:25 3. Agenda
  • 05:22 4. 1. 最新のファージ"設計"AIの問題
  • 08:47 5. 2. 私たちが開発中のファージ設計AI: PhaKit(output, 仮説ツリー)
  • 09:55 6. 3. AIに渡すデータ形式(input)
  • 13:35 7. ① FASTA→CDS/変異
  • 14:42 8. ② Gemmaによる仮説候補の選択
  • 16:55 9. 4. このシステムをどう作ったか
  • 19:30 10. 5. まとめ
  • 21:06 11. 質問タイム

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