AI駆動バイオインフォマティクス研究会

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TogoMCP開発にみるAI-ready dataの理想と現実

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TogoMCP開発にみるAI-ready dataの理想と現実

AI駆動バイオインフォマティクス研究会 第1回 講演紹介

2026年8月27日に開催された AI駆動バイオインフォマティクス研究会(第1回) における、金城玲氏による講演 「TogoMCP開発にみるAI-ready dataの理想と現実」 をお送りします。本講演では、SPARQLを書くことなく、異種データベースを横断的に検索できるTogoMCPや、AI readyなデータベースとは何かについて議論しています。

目次

  • 0:00 TogoMCP開発にみるAI-ready dataの理想と現実
  • 0:35 TogoMCPとは
  • 2:33 実行例
  • 3:57 「データを公開すること」と「AIが使えること」は別物
  • 5:48 前提知識(RDF、オントロジー、SPARQL)
  • 8:15 巨大統合グラフは把握不能
  • 11:00 MIEファイル
  • 12:30 現実① Silent Failure(沈黙する失敗)
  • 14:38 現実② Co-tenancy(同居グラフ)
  • 16:53 現実③ 同定の失敗
  • 20:00 現実④ データは動く(drift)
  • 23:03 議論したい問い
  • 26:50 まとめ
  • 28:40 質問タイム

見どころダイジェスト

  • 00:00 1. TogoMCP開発にみるAI-ready dataの理想と現実
  • 00:35 2. TogoMCPとは
  • 02:33 3. 実行例
  • 03:57 4. 「データを公開すること」と「AIが使えること」は別物
  • 05:48 5. 前提知識(RDF、オントロジー、SPARQL)
  • 08:15 6. 巨大統合グラフは把握不能
  • 11:00 7. MIEファイル
  • 12:30 8. 現実① Silent Failure(沈黙する失敗)
  • 14:38 9. 現実② Co-tenancy(同居グラフ)
  • 16:53 10. 現実③ 同定の失敗
  • 20:00 11. 現実④ データは動く(drift)
  • 23:03 12. 議論したい問い
  • 26:50 13. まとめ
  • 28:40 14. 質問タイム

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