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Folddiscoを使って、タンパク質のモチーフの検索をする （2026年版）
Folddisco 解説動画
Folddiscoは、タンパク質の部分的な立体構造のモチーフ（タンパク質の局所的な三次元配置）に基づいて類似構造を高速に検索できるソフトウェアです。近年開発されたFoldseekはタンパク質全体の立体構造の類似性検索を行うのに対し、Folddiscoは部分モチーフの検索に特化しています。この動画では、ゲノムやタンパク質の立体構造解析に専門的でない方も直感的に理解できるように解説していきます。視聴後には、Folddiscoを使用することで、配列相同性だけでは見つけることが難しい遠縁のタンパク質の類似構造のモチーフを検索、比較することができます。
関連リンク
見どころダイジェスト
- 00:07 1. 導入部
- 00:51 2. UniProtでマウスのEgr1タンパク質のPDBファイルの取得
- 02:27 3. FolddiscoでEgr1タンパク質のモチーフ検索
- 05:04 4. FolddiscoでEgr1タンパク質のモチーフ検索結果
- 09:27 5. まとめ
- 09:49 6. 発展内容
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260825_nakagawa.mov