Foldseek 解説動画

Foldseekは、立体構造に基づいて類似構造を高速に検索できるソフトウェアです。

本動画では、近年のAlphaFold などの構造予測技術の発展により急増したタンパク質構造予測データを効率よく比較するために開発されたFoldseekについて、UniProtの構造ビューアからFoldseekへアクセスできる連携機能を通して使い方を説明します。タンパク質の立体構造解析に専門的でない方でも直感的に理解できるように解説していきます。

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2026.04.20

11:31

作者:  中川 天馬

編集:  森岡勝樹

UniProtからFoldseekを使って高速にタンパク質構造の類似性を検索する

Foldseek 解説動画

Foldseek 解説動画

Foldseekは、立体構造に基づいて類似構造を高速に検索できるソフトウェアです。

本動画では、近年のAlphaFold などの構造予測技術の発展により急増したタンパク質構造予測データを効率よく比較するために開発されたFoldseekについて、UniProtの構造ビューアからFoldseekへアクセスできる連携機能を通して使い方を説明します。タンパク質の立体構造解析に専門的でない方でも直感的に理解できるように解説していきます。

  • Foldseek
  • タンパク質構造
  • 構造類似検索
  • AlphaFold
  • UniProt

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    見どころダイジェスト

    • 00:07 1. 導入部
    • 00:43 2. UniProtでE. coli由来のmurAを検索
    • 02:43 3. Foldseekで大腸菌由来のmurAを検索する
    • 05:12 4. 結果の表示と説明
    • 10:31 5. pymolで多重構造アライメント
    • 10:49 6. まとめ
    • 10:55 7. 発展内容
    • 11:11 8. 注意点

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      20260420_nakagawa.mov

      DOI

      https://doi.org/10.7875/togotv.2026.021

      再利用時のライセンス

      クリエイティブ・コモンズ CC-BY-4.0
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      Foldseek 解説動画

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      Foldseekは、立体構造に基づいて類似構造を高速に検索できるソフトウェアです。

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      本動画では、近年のAlphaFold などの構造予測技術の発展により急増したタンパク質構造予測データを効率よく比較するために開発されたFoldseekについて、UniProtの構造ビューアからFoldseekへアクセスできる連携機能を通して使い方を説明します。タンパク質の立体構造解析に専門的でない方でも直感的に理解できるように解説していきます。

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