データ解析講習会:AJACS「空間トランスクリプトーム解析を知って・学んで・使う」

解析事例(腫瘍微小環境/SKNY)@ データ解析講習会:AJACS「空間トランスクリプトーム解析を知って・学んで・使う」

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解析事例(腫瘍微小環境/SKNY)@ データ解析講習会:AJACS「空間トランスクリプトーム解析を知って・学んで・使う」

本日の統合TVは、2025年12月18日に開催されたデータ解析講習会:AJACS「空間トランスクリプトーム解析を知って・学んで・使う」から、東京大学 酒井 俊輔氏 による「解析事例(腫瘍微小環境/SKNY)」(講習スライドQ&A)をお送りします。
空間オミクス解析/シングルセル解析に関連する複数のライブラリ (scanpy、stlearn、squidpy) を組み合わせた解析事例を紹介します。また、がん胞巣や血管性ニッチェなどの局所的な微小環境解析に特化したアルゴリズムSpatialKNifeY (SKNY) を紹介します。
講習会の一連の動画はYouTubeの再生リストからもご覧いただけます。

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260131_sakai2.mov

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