UniProtからSPARQLを使って情報を取得する

SPARQL(スパークル)は、RDF形式のデータに問い合わせを行うためのクエリ言語です。RDFでは情報がトリプル(主語–述語–目的語)で表されます。SPARQLはこのトリプルの集合(知識グラフ)に対して、「どんな主語が、この述語を持って、この目的語につながるのか?」とデータベースに問い合わせるための言語です。 この動画では、データベースがRDF化されているUniProtを対象に、SPARQLを活用して情報を取得し、 SPARQL supportを使った問い合わせ例や、 Endpoint Browserを使ったRDFの可視化方法について説明します。

見どころダイジェスト

  • 00:07 1. SPARQLの概要
  • 00:25 2. UniProt SPARQLによる検索例1
  • 02:11 3. UniProt SPARQLによる検索例2
  • 03:27 4. UniProt SPARQLのまとめ
  • 03:40 5. SPARQL supportを使った問い合わせ例

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