Posit Cloud (旧:RStudio Cloud) を用いて生物配列データ解析に取り組む @ AJACSオンライン18

本日の統合TVは、2023年11月16日に開催された統合データベース講習会:AJACSオンライン18から、鈴木 治夫 氏 (慶應義塾大学 環境情報学部 准教授) による「Posit Cloud (旧:RStudio Cloud) を用いて生物配列データ解析に取り組む」(講習スライド)をお送りします。本講義では、Posit Cloud (旧:RStudio Cloud) を利用してバイオインフォマティクスに取り組みます。具体的には、 SeqinRパッケージなどを使用し、生物のゲノム・遺伝子 (核酸塩基)・タンパク質 (アミノ酸) の配列データ解析を学びます。
講習会の一連の動画はYouTubeの再生リストからもご覧いただけます。

見どころダイジェスト

  • 01:05 1. 準備
  • 03:35 2. 使用するスクリプトの説明
  • 18:25 3. DNA配列の統計
  • 24:00 4. 質疑応答1
  • 27:37 5. DNA配列の統計つづき
  • 39:30 6. 質疑応答2
  • 7. ドットプロットで2つの配列を比較
  • 49:39 7. 質疑応答3

動画ファイルのダウンロード

231212_03_suzuki.mov

再利用時のライセンス

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