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プロテオームデータの解析とマルチオミクスへの活用 @ AJACSオンライン17
本日の統合TVは、2023年8月30日に開催された統合データベース講習会:AJACSオンライン17から、新潟大学 医歯学系 松本 雅記 氏 による「プロテオームデータの解析とマルチオミクスへの活用」(講習スライド)をお送りします。
本講習は、質量分析計を用いたプロテオーム解析のデータは多様でそれぞれに応じたデータ解析が必要であることを踏まえ、公共リポジトリに集積されたプロテオームデータの利活用を自在にできるようになることを目的としています。 講習会の一連の動画はYouTubeの再生リストからもご覧いただけます。
本講習は、質量分析計を用いたプロテオーム解析のデータは多様でそれぞれに応じたデータ解析が必要であることを踏まえ、公共リポジトリに集積されたプロテオームデータの利活用を自在にできるようになることを目的としています。 講習会の一連の動画はYouTubeの再生リストからもご覧いただけます。
見どころダイジェスト
- 00:22 1. 遺伝子はタンパク質の設計図である
- 01:13 2. ゲノム情報と分子計測技術の組み合わせが可能にしたポストゲノム研究
- 02:43 3. 蓄積するプロテオームデータ
- 04:16 4. jPOST Database
- 09:23 5. jPOST Repository
- 10:03 6. リポジトリにあるrawデータを活用するには?
- 13:25 7. 質量分析計によるプロテオーム解析の原理
- 22:46 8. 質量分析計を基盤とするプロテオミクスの概要
- 26:12 9. LC-MS/MSにおける測定モードの多様化
- 28:05 10. Data-dependent acquisition (DDA)モードによるLC-MS/MS測定
- 29:22 11. DDAによるタンパク質同定の原理
- 31:45 12. ラベル化しない定量法
- 36:30 13. ラベル化による定量法
- 40:38 14. Public dataの活用:jPOST Repository
- 47:22 15. DDAのデータ解析
- 55:30 16. DIAのデータ解析
- 58:32 17. 多様化するプロテオーム研究
- 59:10 18. データ解析ツールの紹介
- 01:00:56 19. まとめと展望
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230910_AJACSonline17_02_matsumoto.mov