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Reactome を使ってパスウェイ情報を検索する〜基本操作編〜
Reactome はヒトの生体中での反応やパスウェイを整備したデータベースです。それぞれの分野の専門家が編集しているため、信頼性の高いデータが得られます。代謝以外にもシグナル伝達や膜輸送、感染など様々なパスウェイが扱われています。RNA-seq(トランスクリプトーム)やプロテオーム、メタボロームなどのオミックス解析の結果を解釈する際にも利用できます。今回は、基本操作編としてReactomeが提供するパスウェイデータの閲覧方法を紹介します。
見どころダイジェスト
- 00:10 1. Reactomeの紹介
- 00:36 2. ウェブサイトにアクセスする
- 00:43 3. Pathway Browserにアクセスする
- 00:53 4. 機能の紹介
- 01:37 5. キーワードから検索する
- 01:56 6. Pathway Browserの使用例
- 03:24 7. 分子の情報を見る
- 06:19 8. パスウェイの流れを読み解く
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230625_Reactome_basic.mov