バイオインフォマティクスツール・パッケージを自作する

TDbasedUFE on Bioconductor 3.17 @ Bio”Pack”athon2023#3

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TDbasedUFE on Bioconductor 3.17 @ Bio”Pack”athon2023#3

2023年3月16日に開催されたBio"Pack"athon 2023 #3から、田口 善弘氏による「TDbasedUFE on Bioconductor 3.17」をお送りします。本講演では、田口氏が開発した、テンソル分解を利用してオミックスデータから、特徴量を抽出するTDbasedUFE(Tensor Decomposition Based Unsupervised Feature Extraction)パッケージや、パッケージをBioconductorに投稿した際の経験談について紹介しています。この講演動画は、Bio”Pack”athon(バイオパッカソン)からご寄託いただきました。 Bio”Pack”athonでは、以下のような活動をしています。
  • ・パッケージ開発に関するミートアップ(月一開催)
  • ・日本語によるパッケージング教材の拡充化
  • Bioconductorへの登録サポート
パッケージングに興味がある方、 パッケージ化したいデータベースや 解析手法がある方は、ぜひお気軽に ご参加ください。Twitterアカウント@biopackathonにて最新情報を発信しています。

見どころダイジェスト

  • 01:28 1. Bioconductor投稿記
  • 21:13 2. TDbasedUFEの機能説明
  • 29:53 3. TDbasedUFEのデモンストレーション
  • 43:16 4. TDbasedUFEのデモンストレーション(マルチオミックス)
  • 53:38 5. まとめ
  • 55:23 6. 質問タイム

動画ファイルのダウンロード

230321_02_taguchi.mov

再利用時のライセンス

クリエイティブ・コモンズ CC-BY-4.0

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