CCLE(Cancer Cell Line Encyclopedia)は、米国ブロード研究所 (Broad Institute)が提供するヒトがん細胞株のデータポータルです(原著論文: Next-generation characterization of the Cancer Cell Line Encyclopedia)。CCLEでは現在、約1,500種に及ぶ様々ながん細胞株における遺伝子発現、変異、RNAスプライシング、DNAメチル化、ヒストンH3修飾、マイクロRNA発現、タンパク質アレイなどのデータがまとめられています。CCLEで提供されているデータと、すでに公開されているさまざまな遺伝子アノテーションや薬剤感受性などの薬理学データ(例: depmap (the Cancer Dependency Map: 統合TVによる解説「depmapを使ってがん細胞が依存する遺伝子の情報を調べる (がんの治療標的となる遺伝子を発見する)」)) との関連付けを行うことで、抗がん剤および関連するバイオマーカー探索などを効率的にすすめることができます。