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塩基配列解析およびゲノム編集のためのデータベース・ウェブツール @ AJACS番町1
本日の統合TVは、2018年8月29日に開催された統合データベース講習会:AJACS番町1から、ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS) 内藤 雄樹 による「塩基配列解析およびゲノム編集のためのデータベース・ウェブツール」をお送りします。約1時間8分です。
本講習では、主にNCBI データベース、NCBI BLAST、UCSC BLAT、UCSCゲノムブラウザの基本的な使い方について実習形式で紹介しています。
また､塩基配列検索に関連する有用サイトとして､統合遺伝子検索GGRNA、高速配列検索GGGenome、siRNA設計ウェブサーバsiDirect、CRISPR設計ウェブサーバCRISPRdirectの使い方についても活用例を交えながら紹介しています｡
この動画と講習資料が同時に見られる「講習会 実習資料(AJACS)」ページはこちらです。
講習会の一連の動画はYouTubeの再生リストからもご覧いただけます。
本講習では、主にNCBI データベース、NCBI BLAST、UCSC BLAT、UCSCゲノムブラウザの基本的な使い方について実習形式で紹介しています。
また､塩基配列検索に関連する有用サイトとして､統合遺伝子検索GGRNA、高速配列検索GGGenome、siRNA設計ウェブサーバsiDirect、CRISPR設計ウェブサーバCRISPRdirectの使い方についても活用例を交えながら紹介しています｡
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見どころダイジェスト
- 05:05 1. 遺伝子に関するデータベース(NCBI)
- 11:58 2. 遺伝子のIDとは？
- 18:53 3. 塩基配列から遺伝子をさがす(NCBI BLAST、UCSC BLAT)
- 24:31 4. 統合遺伝子検索 GGRNA
- 37:15 5. GGGenomeによる塩基配列検索
- 53:37 6. CRISPRdirectによるガイドRNA設計
動画ファイルのダウンロード
180922_AJACS71_03_naito.mov