UCSC Genome Browserで表示できるアノテーションを調べる 2018

UCSC Genome Browserは、 米国カリフォルニア大学サンタクルーズ校(UCSC)が開発、維持しているゲノムブラウザ、ゲノムアノテーション閲覧システムです。ゲノムブラウザとはアノテーション(注釈)が付加された遺伝子のゲノム上の位置やその周辺を表示するツールのことです。今回は、UCSC Genome Browserで閲覧できる多種多様なアノテーション情報について、ゲノムアセンブリによる違いやアノテーションの一覧から検索し表示させる方法などを紹介します。
ちなみに、UCSC Genome Browser のウェブサイトはヨーロッパとアジアにミラーサイトがあり(UCSC Genome Browser Mirror Sites)、日本からアクセスする場合には、アジアのミラーサイト(RIKEN横浜キャンパス)を使うとさらに高速です。

見どころダイジェスト

  • 00:59 1. UCSC Genome Browser におけるアノテーショントラックの設定方法
  • 02:49 2. ゲノムアセンブリによるアノテーションの違い
  • 03:15 3. Configure 機能 を使ったトラックの設定方法
  • 04:17 4. トラック検索機能 を使ったトラックの設定方法
  • 05:56 5. Configure 機能およびトラック検索機能をショットカットキーで表示させる

動画ファイルのダウンロード

180710_UCSC_annotation.mov

再利用時のライセンス

クリエイティブ・コモンズ CC-BY-4.0

スキル別コースから探す

    新着動画

      視聴ランキング

        新着イラスト