Pitagora Galaxyを使ってマウス操作だけでRNA-seq解析をする

RNA-seqは、次世代シーケンサーを使って組織や細胞の全遺伝子の発現量を網羅的に解析する手法です。非常に有益な手法ですが、それらの解析の多くはコマンドライン操作をともなうため、コマンドライン操作に慣れていない人にとっては敷居が高く敬遠されがちです。
Pitagora Galaxyは、RNA-seqのようなビッグデータでも自身のパソコンを使ってマウス操作だけで解析ができるツールです。本動画では、Pitagora Galaxyを使って、マウス操作だけでRNA-seq解析をする方法を紹介します。

見どころダイジェスト

  • 00:35 1. Pitagora Galaxyのセッティング
  • 01:51 2. サンプルデータのダウンロード
  • 02:57 3. Pitagora GalaxyでRNA−seq解析
  • 05:02 4. Tophatの実行
  • 05:52 5. Cuffdiffの実行

動画ファイルのダウンロード

160405pitagora_RNAseq.mov

再利用時のライセンス

クリエイティブ・コモンズ CC-BY-4.0

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