HomoloGeneを用いた相同な遺伝子の検索

NCBIが提供するHomoloGeneは、真核生物間の相同的な遺伝子を検索するツールです。種間比較や系統樹作成のために、興味のある相同遺伝子を一括で取得することができます。 本動画では、系統樹作成の前段階として、まずHomoloGeneにリストされている生物のアミノ酸配列を一括取得する方法を解説(例:活性酸素分解酵素SOD1)し、次にHomoloGeneにリストされていない生物のアミノ酸配列を検索し、取得(例:Bombyx mori(カイコ)のSOD1)する方法について解説します。

見どころダイジェスト

  • 050 1. HomoloGeneにリストされている生物のアミノ酸配列の検索
  • 127 2. アミノ酸配列のダウンロード
  • 217 3. カイコのアミノ酸配列のダウンロード

動画ファイルのダウンロード

150714_homologene.mov

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