ChEMBLを使って医薬品候補となる化合物について調べる

ChEMBLdbは、創薬研究に有用な医薬品化合物の情報を提供するデータベースです。現在、約50万個の化合物情報、約190万件の活性情報及びそれらのターゲット情報が登録されています。ユーザーは、生物活性化合物の情報を部分構造検索や類似性検索で調査したり、また、ターゲットのアミノ酸配列からBLAST検索でアッセイ情報を収集することができます。今回は、タンパク質を名前/系統樹/BLAST配列から指定しリガンドを探すTarget Search機能と、化合物の構造を投げ、類似性から探す/名前から探す/SMILE・IDから探すCompound Searchを中心に説明します。

見どころダイジェスト

  • 00:38 1. 標的のタンパク質などの名前を入力し、"Target" で検索する
  • 01:52 2. Compound Report Card
  • 02:38 3. FASTA 配列から目的タンパク質を指定しリガンドとなる化合物を探す
  • 03:27 4. 目的化合物の名称から検索
  • 03:52 5. 医薬品情報を確認する

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140302chembl.mov

再利用時のライセンス

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