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Local blast の使い方〜検索実行編〜
本日の統合TVは、自分のコンピュータでBLAST検索を実行する方法を紹介します。
現在、さまざまなデータベースに対してウェブ経由でBLAST検索を実行できます。しかしながら、実行速度が遅かったり、大量に検索すると怒られたり、自分の望むデータベースがなかったりする場合があります。また、まだ公開していない配列データに対してBLAST検索を実行したい場合もあるかもしれません。そんなときには、自分のコンピュータにBLASTをインストールして、ローカルでBLAST検索を実行してしまいましょう!
今回はその第四弾、いよいよBLAST検索を実行する方法について紹介します。前回作成した酵母のアミノ酸配列データベースに対して、サンプル配列と類似の配列を検索しています。