siDirectのオプションを使いこなす&shRNAを設計する

siDirect(「エスアイダイレクト」と読みます)はそのsiRNAをデザインする日本発のツールです。インターフェースや説明書きがすべて英語となっており日本語化されていないので素人にはなじみにくいかもしれませんが、設計したsiRNAが他の遺伝子に影響を及ぼさないか他の遺伝子配列にたいする配列類似性検索も同時に行うことができ、便利なツールとなっています。前回の動画ではsiRNAの設計の基本を紹介しました。siDirectはいくつかの設計オプションを設定することができます。また、設計オプションを使用することでshRNAの設計をすることもできます。今回の動画では、siDirectのオプションの使い方およびshRNAの設計法について紹介します。

見どころダイジェスト

  • 1.siDirectにアクセスする (7秒)
  • 01:01 2.設計オプションの詳細
  • 04:03 3.shRNAの設計

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110712sidirect2_ouyouhen.mov

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