siDirectでsiRNAを設計する 2011

siRNA(「エスアイアールエヌエー」と読みます、small interfering RNAの略です)を用いてRNAi(RNA interference)を起こして目的のmRNAをノックダウンすることが哺乳類に対してもできることが最近わかってきました。 siDirect(「エスアイダイレクト」と読みます)はそのsiRNAをデザインする日本発のツールです。インターフェースや説明書きがすべて英語となっており日本語化されていないので素人にはなじみにくいかもしれませんが、設計したsiRNAが他の遺伝子に影響を及ぼさないか他の遺伝子配列にたいする配列類似性検索も同時に行うことができ、便利なツールとなっています。 ただ、そのsiRNAが実際に効いたかどうか等の実験結果は反映されていないのが残念な点です(効いたかどうか確かめたもの(verified)を集めたsiRNAがライブラリという形で売られていますが自分の目的とする細胞(cell line)や組織で効くかどうかはまた別問題です)。

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