バイオインフォマティクスツール･パッケージを自作する
Previous
Juliaパッケージ開発・JOSS投稿体験記@ Bio”Pack”athon2025#7
Next
Click here to see the videos in the course.
この動画が再生されない場合は、YouTubeでご覧ください。https://youtu.be/QPkhSonrKbY
Juliaパッケージ開発・JOSS投稿体験記@ Bio”Pack”athon2025#7
2025年7月16日に開催された、Bio"Pack"athon 2025 #7の露崎弘毅氏による「Juliaパッケージ開発・JOSS投稿体験記」をお送りします。本講演では、同氏が開発したJuliaパッケージである OnlinePCA.jlと OnlineNMF.jlを開発した手順や、Juliaの公式レポジトリ（ General）及びオープンソースソフトウェアの論文誌であるJOSSに投稿した際の体験談を紹介しています。
この講演動画は、Bio"Pack"athon（バイオパッカソン）からご寄託いただきました。
Bio”Pack”athonでは、以下のような活動をしています。
- ・パッケージ開発に関するミートアップ（月一開催）
- ・日本語によるパッケージング教材の拡充化
- ・Bioconductorへの登録サポート
Highlights
- 00:00 1. Juliaパッケージ開発・投稿体験記
- 01:27 2. Juliaパッケージの開発
- 02:00 3. Juliaup
- 03:19 4. PkgTemplates.jl
- 04:35 5. ディレクトリ構成
- 05:43 6. Project.toml
- 07:17 7. Project.tomlと環境
- 09:07 8. Manifest.toml
- 10:12 9. Revise.jl
- 12:02 10. Pkg.test
- 12:55 11. Documenter.jl
- 14:59 12. リファクタリング
- 18:16 13. README.md
- 18:48 14. CI（各種YAMLファイル）
- 20:46 15. まとめ（前半）
- 22:17 16. Juliaパッケージの投稿
- 22:30 17. Generalへの投稿
- 25:22 18. JOSSへの投稿
- 27:27 19. まとめ（後半）
- 27:51 20. 質問タイム
Download the video file
250719_tsuyuzaki.mov