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検出されない代謝物を考慮したエンリッチメント解析 @ Bio”Pack”athon2025#6
2025年6月30日に開催された、Bio"Pack"athon 2025 #6の山本博之氏による「検出されない代謝物を考慮したエンリッチメント解析」をお送りします。本講習で、検出されたメタボロームデータに関与するパスウェイを絞り込む「エンリッチメント解析」に置いて、検定で有意になるパスウェイの数が不当に多くなる（または少なくなる）バイアスを紹介しており、そのバイアスを補正した新規エンリッチメント解析手法を紹介しています。
この講演動画は、Bio"Pack"athon（バイオパッカソン）からご寄託いただきました。
Bio”Pack”athonでは、以下のような活動をしています。
- ・パッケージ開発に関するミートアップ（月一開催）
- ・日本語によるパッケージング教材の拡充化
- ・Bioconductorへの登録サポート
Highlights
- 00:00 1. 検出されない代謝物を考慮したエンリッチメント解析
- 00:56 2. メタボロームデータ解析の流れ
- 01:32 3. エンリッチメント解析とは
- 02:00 4. Over Representation Analysis（ORA）の概要
- 03:36 5. エンリッチメント解析の方法
- 03:56 6. 超幾何確率
- 04:57 7. クロス集計表のパターンとそれぞれの確率
- 05:19 8. 期待値の計算
- 05:40 9. カイニ乗検定
- 06:15 10. フィッシャーの正確確率検定
- 06:43 11. MetaboAnalystによるエンリッチメント解析
- 08:52 12. MetaboAnalystによるエンリッチメント解析の問題点①
- 13. MetaboAnaly
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250718_yamamoto.mov