バイオインフォマティクスツール･パッケージを自作する
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Cell-type Deconvolutionの解説 @ Bio”Pack”athon2025#2
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Cell-type Deconvolutionの解説 @ Bio”Pack”athon2025#2
2025年2月12日に開催されたBio"Pack"athon 2025 #1 から、露崎弘毅氏による「Cell-type Deconvolutionの解説」をお送りします。本講演では、バルクオミックスデータに含まれる細胞型の比率を推定するデータ解析Cell-type Deconvolutionについて、基礎的な解説や最新の研究動向などを紹介しています。
この講演動画は、Bio”Pack”athon（バイオパッカソン）からご寄託いただきました。 Bio”Pack”athonでは、以下のような活動をしています。
- ・パッケージ開発に関するミートアップ(月一開催)
- ・日本語によるパッケージング教材の拡充化
- ・Bioconductorへの登録サポート
Highlights
- 00:10 1. 目次
- 01:23 2. Cell-type Deconvolutionとは
- 19:38 3. 適用事例（各種オミックス解析）
- 25:45 4. 数学寄りの解説
- 33:31 5. まとめ（前半）
- 35:06 6. 質問タイム（前半）
- 42:10 7. おすすめツール
- 51:50 8. ベンチマーク論文
- 56:40 9. 既存手法の課題
- 01:12:24 10. まとめ（後半）
- 01:13:11 11. 質問タイム（後半）
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250214_tsuyuzaki.mov