バイオインフォマティクスツール･パッケージを自作する
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Nix ~再現性のある環境を用意する手段の1つとしての使い方~ @ Bio”Pack”athon2025#1
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Nix ~再現性のある環境を用意する手段の1つとしての使い方~ @ Bio”Pack”athon2025#1
2025年1月22日に開催されたBio"Pack"athon 2025 #1 から、長田 悠生 氏による「Nix ~再現性のある環境を用意する手段の1つとしての使い方~」をお送りします。本講演では、再現性のある開発環境を構築するツールであるNixの基礎や、Nix環境をより簡単に構築するためのRパッケージであるrixやRakeなどを紹介しています。
この講演動画は、Bio”Pack”athon（バイオパッカソン）からご寄託いただきました。 Bio”Pack”athonでは、以下のような活動をしています。
- ・パッケージ開発に関するミートアップ(月一開催)
- ・日本語によるパッケージング教材の拡充化
- ・Bioconductorへの登録サポート
Highlights
- 00:16 1. 自己紹介
- 00:49 2. 目次
- 01:03 3. Nixの紹介
- 01:06 4. Nixとは
- 01:47 5. パッケージマネージャーとは
- 02:58 6. Nixのパッケージ数は膨大
- 03:28 7. Nixの魅力（再現性、宣言的、信頼性）
- 03:55 8. 再現性（Dockerとの比較）
- 05:05 9. ハッシュ値による各パッケージの区別
- 06:36 10. 宣言的: devtoolsをインストール（flake.nix）
- 07:46 11. 手続き的にdevtoolsをインストール（apt install）
- 08:57 12. 信頼性
- 09:27 13. rixの紹介
- 09:30 14. rixとは（default.nixの生成）
- 11:16 15. rix入門
- 11:35 16. rixのデモ
- 15:17 17. 私が現在開発中の「rake」の紹介
- 15:29 18. Nix関連の開発環境（nix-shellとdevShell）
- 16:38 19. flake.nixの例
- 18:25 20. rakeとは（flake.nixの生成）
- 20:36 21. 質問タイム
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250124_Nix.mov