バイオインフォマティクスツール・パッケージを自作する

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R RmarkdownユーザーのためのQuarto @ Bio”Pack”athon2024#12

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R RmarkdownユーザーのためのQuarto @ Bio”Pack”athon2024#12

2024年12月11日に開催されたBio"Pack"athon 2024 #12 から、ニッタ ジョエル氏による「R MarkdownユーザーのためのQuarto」をお送りします。本講演では、R言語における動的なドキュメント作成支援ツールであるR Markdownの後継であるQuarto(クォルト)を紹介しています。Quartoを利用することで、R以外のPython, Juliaなどのプログラミング言語においても、コード、テキスト、図表、解析結果などを1つの文章上でまとめることができ、HTML、PDF、Word、プレゼンテーションなど、様々なファイル形式で出力できるようになります。 この講演動画は、Bio”Pack”athon(バイオパッカソン)からご寄託いただきました。 Bio”Pack”athonでは、以下のような活動をしています。
  • ・パッケージ開発に関するミートアップ(月一開催)
  • ・日本語によるパッケージング教材の拡充化
  • Bioconductorへの登録サポート
パッケージングに興味がある方、 パッケージ化したいデータベースや 解析手法がある方は、ぜひお気軽に ご参加ください。Twitterアカウント@biopackathonにて最新情報を発信しています。

Highlights

  • 00:16 1. 自己紹介
  • 01:06 2. 誰のためのお話?
  • 01:36 3. 注意
  • 02:52 4. アウトライン
  • 03:12 5. Quartoとは?
  • 07:58 6. QuartoとR Markdownとの違い
  • 21:04 7. Quartoの活用例
  • 31:04 8. 注意点
  • 34:42 9. まとめ
  • 35:38 10. 質問タイム

Download the video file

241223_Quarto.mov

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