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napariを使って画像解析を行う
napariは、最新のイメージング技術による大規模かつ高次元のデータを効果的に可視化・分析するために開発された、Pythonベースの高性能な多次元イメージビューアです。非同期レンダリングによる大規模データのサポートや「レイヤー」機能を使用した複数の画像、モデル、分析結果の同時可視化、3Dでの手動アノテーション機能などの特長があります。今回は、基本操作に加えて、自身のニーズに合わせてnapariの機能を拡張できるプラグインエコシステムについて紹介しています。
Highlights
- 00:07 1. napariの概要
- 00:17 2. napariのインストール
- 00:39 3. napariの起動
- 02:48 4. 2D画像解析の基本操作
- 03:56 5. 3D画像解析の基本操作
- 04:15 6. プラグインの概要
- 04:46 7. プラグインの導入方法
- 05:55 8. プラグインの使用例(stardist-napariとnapari-skimage-regionprops)
- 05:55 9. プラグインの検索方法
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241209_napari.mov