DiGAlignはゲノムの比較 (主にアラインメントと可視化) を行うためのウェブツールで、京都大学 化学研究所が提供しています。（原著論文：DiGAlign: versatile and interactive visualization of sequence alignment for comparative genomics. https://doi.org/10.1264/jsme2.ME23061）DiGAlignは、複雑なゲノム構造の比較をより直観的に行うために、①自動的な配列位置調整機能(逆位や環状置換を含む) ②ガイドツリーによる類似配列の選択支援機能 ③ドットプロットとシンテニーマップの並列表示機能 といった主な機能を備えています。これらの機能はウイルスの系統解析に用いるViPTreeというプログラムを元に、非ウイルスの配列向けに拡張されDiGAlignに実装されています。ゲノム全域での遺伝子構成(部分同士)、つまりシンテニーを比較する手法が実装されており、インデルや逆位の検出に利用できます。 今回は、ヒト、チンパンジー、ゴリラ、テナガザルのチロシナーゼ遺伝子領域を例に、ゲノムの構造を解析する方法を紹介します。