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データサイエンス周りの話題提供 (仮想環境、テキストエディタ、前処理、データベース、バージョン管理) @ Bio”Pack”athon2024#7

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データサイエンス周りの話題提供 (仮想環境、テキストエディタ、前処理、データベース、バージョン管理) @ Bio”Pack”athon2024#7

2024年7月10日に開催されたBio"Pack"athon 2024 #7から、露崎弘毅氏による「データサイエンス周りの話題提供 (仮想環境、テキストエディタ、前処理、データベース、バージョン管理)」をお送りします。本講演では、仮想環境構築で利用されるAnacondaDockerの有償化、RもPythonもNotebookも同じ画面で開発できる話題のテキストエディタPositron、Pythonで高速かつTidyにデータの前処理を行えるようにするパッケージPolars、データ分析により特化した高速なデータベース管理システムであるDuckDB、Git/GitHubライクにデータのバージョン管理を行うツールDVCについて紹介しています。 この講演動画は、Bio”Pack”athon(バイオパッカソン)からご寄託いただきました。 Bio”Pack”athonでは、以下のような活動をしています。
  • ・パッケージ開発に関するミートアップ(月一開催)
  • ・日本語によるパッケージング教材の拡充化
  • Bioconductorへの登録サポート
パッケージングに興味がある方、 パッケージ化したいデータベースや 解析手法がある方は、ぜひお気軽に ご参加ください。Twitterアカウント@biopackathonにて最新情報を発信しています。

Highlights

  • 00:10 1. 目次
  • 00:23 2. 仮想環境(Anaconda)
  • 04:27 3. 仮想環境(Docker)
  • 07:00 4. テキストエディタ(Positron)
  • 12:15 5. 前処理(Polars)
  • 15:36 6. データベース(DuckDB)
  • 23:57 7. バージョン管理(DVC)
  • 26:23 8. まとめ

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240711_Datascience.mov

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