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Posit Cloud (旧：RStudio Cloud) を用いて生物配列データ解析に取り組む @ AJACSオンライン18
本日の統合TVは、2023年11月16日に開催された統合データベース講習会:AJACSオンライン18から、鈴木 治夫 氏 (慶應義塾大学 環境情報学部 准教授) による「Posit Cloud (旧：RStudio Cloud) を用いて生物配列データ解析に取り組む」(講習スライド)をお送りします。本講義では、Posit Cloud (旧：RStudio Cloud) を利用してバイオインフォマティクスに取り組みます。具体的には、 SeqinRパッケージなどを使用し、生物のゲノム・遺伝子 (核酸塩基)・タンパク質 (アミノ酸) の配列データ解析を学びます。
講習会の一連の動画はYouTubeの再生リストからもご覧いただけます。
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Highlights
- 01:05 1. 準備
- 03:35 2. 使用するスクリプトの説明
- 18:25 3. DNA配列の統計
- 24:00 4. 質疑応答1
- 27:37 5. DNA配列の統計つづき
- 39:30 6. 質疑応答2
- 7. ドットプロットで2つの配列を比較
- 49:39 7. 質疑応答3
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231212_03_suzuki.mov