バイオインフォマティクスツール･パッケージを自作する
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pyOpenSciの紹介 @ Bio”Pack”athon2023#9
2023年9月13日に開催されたBio"Pack"athon 2023 #9から、西田孝三氏による「pyOpenSciの紹介」をお送りします。PythonコミュニティであるpyOpenSciの活動（1. Pythonパッケージの査読、2. Journal of Open Source Software（JOSS）誌や、Astropyなど他の科学コミュニティとの連携、3. Pythonパッケージ開発の教材の作成・提供）について紹介しています。この講演動画は、Bio”Pack”athon（バイオパッカソン）からご寄託いただきました。 Bio”Pack”athonでは、以下のような活動をしています。
- ・パッケージ開発に関するミートアップ(月一開催)
- ・日本語によるパッケージング教材の拡充化
- ・Bioconductorへの登録サポート
Highlights
- 00:00 1. pyOpenSciの紹介
- 00:12 2. pyOpenSciとは
- 00:28 3. rOpenSciとは
- 01:59 4. Software Peer Review（査読）の流れ
- 02:51 5. Journal of Open Source Software（JOSS）とは
- 04:42 6. pyOpenSciの活動内容
- 05:17 7. なぜこのような仕組みが必要なのか
- 06:55 8. pyOpenSciの歴史
- 07:23 9. pyOpenSciのメンバー
- 08:42 10. Pythonパッケージ開発のベストプラクティス
- 10:31 11. Software Peer Review
- 14:30 12. Domain specific Partnerships
- 16:25 13. 連絡先
- 17:05 14. 質問タイム
Download the video file
230920_PyOpenSci.mov