バイオインフォマティクスツール･パッケージを自作する
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環境構築フリー&インタラクティブな細胞ブラウザkanaの紹介 @ Bio”Pack”athon2023#5
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環境構築フリー&インタラクティブな細胞ブラウザkanaの紹介 @ Bio”Pack”athon2023#5
2023年5月17日に開催されたBio"Pack"athon 2023 #5から、露崎弘毅氏による「環境構築フリー&インタラクティブな細胞ブラウザkanaの紹介」をお送りします。本講演では、Javascriptで実装されたWebブラウザ上で動作するシングルセルオミックスデータの細胞ブラウザーであるkanaのコンセプトや、使い方について紹介しています。他の細胞ブラウザと比較して、クライアント側で動作するため、サーバー環境を用意する必要が無い、簡単なデータ解析をボタン一つで済ませられるといったメリットがあります。この講演動画は、Bio”Pack”athon（バイオパッカソン）からご寄託いただきました。 Bio”Pack”athonでは、以下のような活動をしています。
- ・パッケージ開発に関するミートアップ(月一開催)
- ・日本語によるパッケージング教材の拡充化
- ・Bioconductorへの登録サポート
Highlights
- 00:00 1. 環境構築フリー&インタラクティブな細胞ブラウザkanaの紹介
- 00:14 2. kanaとは
- 00:19 3. 細胞ブラウザの重要性
- 04:24 4. 既存の細胞ブラウザ
- 08:46 5. kanaのコンセプト
- 10:06 6. kanaの使い方
- 12:53 7. kanaを試してみる
- 16:28 8. kanaによるデータ解析
- 19:19 9. Exploreモード
- 23:56 10. どのようにデータをやりとりするか（現状）
- 25:01 11. 今後追加して欲しい機能
- 29:39 12. まとめ
Download the video file
230524_tsuyuzaki_kana.mov