2023年2月8日に開催された
Bio"Pack"athon 2023 #2から、芳村 美佳 氏による「理解して使うRNA Velocity解析ツール -実践編-」(
講演資料)をお送りします。本講演では、シングルセルオミックス分野で行われるRNA Velocity解析について解説しています。RNA Velocityは、intron由来のsplicedなRNAと、exon由来のunsplicedなRNAの比率に着目することで、細胞の分化の向きをベクトル場として可視化する技術です。velocytoやscVeloといったオープンソースなツールが広く利用されています。しかしながら、背景にある理論が複雑であることから、ブラックボックスとして利用してしまっているユーザーが多くいることと思います。そのため、今回は「理解して使うRNA Velocity解析ツール」と題して、RNA Velocity解析に関する様々なトピックを紹介します。この動画では、そのうちのRNA Velocity解析ツールの使い方について解説します。 この講演動画は、
Bio”Pack”athon(バイオパッカソン)からご寄託いただきました。 Bio”Pack”athonでは、以下のような活動をしています。
- ・パッケージ開発に関するミートアップ(月一開催)
- ・日本語によるパッケージング教材の拡充化
- ・Bioconductorへの登録サポート
パッケージングに興味がある方、 パッケージ化したいデータベースや 解析手法がある方は、ぜひお気軽に ご参加ください。Twitterアカウント
@biopackathonにて最新情報を発信しています。