Previous
Digital Expression Explorer 2 を使って解析済みRNA-seqデータを取得する
Next

Click here to see the videos in the course.
この動画が再生されない場合は、YouTubeでご覧ください。https://youtu.be/V-C3Lnh44Bk
Digital Expression Explorer 2 を使って解析済みRNA-seqデータを取得する
Digital Expression Explorer 2 (DEE2) は未処理のRNA-Seqデータ (fastqファイル) を解析し、解析済みデータとして公開するサービスです。公共データを利用する際に必要な、適切な計算機の用意やツールのインストール、ツールの実行を自身で行うことなく、公共データを再解析することができます。DEE2では SRA やGEOのアクセッション番号を入力することで、品質チェック結果と、transcriptごと、遺伝子ごとの発現定量の結果をダウンロードすることができます。本動画では、公共遺伝子発現データベース目次
All of gene expression (AOE) をm用いて、出芽酵母 (Saccharomyces cerevisiae) とエタノールの
ストレスによる発現変動に関するデータを検索し、DEE2でそれらの解析済みデータを取得する方法について説明します。