バイオインフォマティクスツール･パッケージを自作する
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GitHub Packagesによるツール開発･公開 @ Bio”Pack”athon2021#12
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この動画が再生されない場合は、YouTubeでご覧ください。https://youtu.be/vyVOptpSqV0
GitHub Packagesによるツール開発･公開 @ Bio”Pack”athon2021#12
2021年12月8日に開催された、Bio"Pack"athon 2021 #12の露崎 弘毅氏による「GitHub Packagesによるツール開発･公開」をお送りします。
本講習では、ソースコードを公開するGitHubと、ツールをインストールしたコンテナ環境を公開するDocker Hubを紹介し、これらを連携させることで、より再現性の高いツールを開発できることを説明しています。
また、GitHubが2020年9月から始めたGitHub Container Registory(GHCR) とGitHub Actionsを組み合わせることで、開発したツールを自動的にDockerコンテナ化して公開する手順を紹介しています。
この講演動画は、Bio”Pack”athon（バイオパッカソン）からご寄託いただきました。
Bio”Pack”athonでは、以下のような活動をしています。
- ・パッケージ開発に関するミートアップ(月一開催)
- ・日本語によるパッケージング教材の拡充化
- ・Bioconductorへの登録サポート
Highlights
- 00:00 1. GitHub Packagesによるツール開発・公開
- 00:11 2. Git/GitHubについて
- 01:49 3. Docker/DockerHubについて
- 02:34 4. Git⇄Docker連携
- 03:26 5-1. Dockerfile内でGitHub上のコードを参照
- 05:45 5-2. DockerHubの自動ビルド機能
- 07:26 5-3. GitHub Actions + DockerHub
- 11:51 5-4. GitHub Actions + GHCR
- 17:26 6. まとめ
- 19:18 7. 質問タイム
Download the video file
220617_GitHubPackages.mov