バイオインフォマティクスツール･パッケージを自作する
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最短で習得するRパッケージ開発入門(後編) @ Bio”Pack”athon2022#5
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この動画が再生されない場合は、YouTubeでご覧ください。https://youtu.be/i-AHbp4tCZ8
最短で習得するRパッケージ開発入門(後編) @ Bio”Pack”athon2022#5
2022年6月8日に開催された、Bio"Pack"athon 2022 #6の露崎 弘毅氏による「最短で習得するRパッケージ開発入門(後編)」をお送りします。
本講習では、RStudioと各種パッケージング支援パッケージを利用した、Rパッケージの開発の仕方を紹介しています。
本トークは、オライリーの「Rパッケージ開発入門」を参考にしました。
この講演動画は、Bio”Pack”athon（バイオパッカソン）からご寄託いただきました。
Bio”Pack”athonでは、以下のような活動をしています。
- ・パッケージ開発に関するミートアップ(月一開催)
- ・日本語によるパッケージング教材の拡充化
- ・Bioconductorへの登録サポート
Highlights
- 00:00 1. 最短で習得するRパッケージ開発入門(後編)
- 04:16 2. Step 1: パッケージング環境を用意
- 06:54 3. Step 2: ディレクトリ構造を生成
- 08:37 4. Step 3: Rプロジェクトの設定
- 00:20 5. Step 4: Git/GitHub連携
- 16:25 6. Step 5: DESCRIPTIONを編集
- 19:44 7. Step 6: Rスクリプトファイルを配置
- 20:44 8. Step 7: Rスクリプトを編集
- 23:44 9. Step 8: ヘルプファイル、NAMESPACE自動生成
- 25:36 10. Step 9: NEWSを生成
- 26:34 11. Step 10: READMEを生成
- 27:30 12. Step 11: ヴィネットの作成
- 29:47 13. Step 12: 単体テスト
- 32:10 14. Step 13: パッケージ全体のチェック
- 33:55 15. Step 14: リリース
- 38:49 16. 旧式のやり方との比較
- 42:00 17. 質問タイム
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220613_Rpackage.mov