バイオインフォマティクスツール･パッケージを自作する
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データ解析者、ツール開発者のDocker利用シーン5選 @ Bio”Pack”athon2021#4
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この動画が再生されない場合は、YouTubeでご覧ください。https://youtu.be/EPIuHNQxuMM
データ解析者、ツール開発者のDocker利用シーン5選 @ Bio”Pack”athon2021#4
2021年4月14日に開催された、Bio"Pack"athon 2021 #5の露崎 弘毅氏による「データ解析者、ツール開発者のDocker利用シーン5選」をお送りします。
本講習では、仮想化技術の一つであるDockerについて紹介しています。
Dockerを利用することで、あらかじめ解析に必要なツールをインストールした環境を丸ごとコンテナとして公開できるため、開発したツールを再現良く別の環境で実行できます。
本講習では、それ以外にも、露崎氏が厳選したDocker利用シーンを5つほど紹介してもらっています。
この講演動画は、Bio”Pack”athon（バイオパッカソン）からご寄託いただきました。
Bio”Pack”athonでは、以下のような活動をしています。
- ・パッケージ開発に関するミートアップ(月一開催)
- ・日本語によるパッケージング教材の拡充化
- ・Bioconductorへの登録サポート
Highlights
- 00:00 1. データ解析者、ツール開発者のDocker利用シーン5選
- 00:14 2. データサイエンスにおける再現性関連技術
- 01:01 3. コンテナ化、Dockerとは
- 03:43 4. コンテナ化とパッケージ開発の意識の違い
- 05:10 5. コンテナ化とワークフロー言語の意識の違い
- 08:19 6. Dockerの使い方
- 11:53 7. Dockerfileの書き方
- 13:32 8. Rパッケージ開発者に重要なDockerイメージ
- 15:34 9. 利用シーン1 データ解析
- 20:12 10. 利用シーン2 パッケージ開発
- 24:54 11. 利用シーン3 講習会資料の公開
- 26:36 12. 利用シーン4 共用計算機上での利用
- 29:53 13. 利用シーン5 Code Ocean
- 32:53 14. まとめ
Download the video file
220610_Docker.mov