この動画が再生されない場合は、YouTubeでご覧ください。https://youtu.be/Ny8QlQ8tVMU
Jalviewを使って配列解析･系統樹解析をする
Jalviewは多重アラインメントの結果から分子系統樹を作成することができるビューワー/エディターです。今回は、MacにインストールしたJalviewを使用して、多重アラインメントの結果を読み込み、分子系統樹の作成、多重アライメントされた配列の削除・追加、画像として保存する方法などについて紹介します。また、ローカルマシンにインストールが不要なJalview JSについてもインストール版との違いなどを中心に紹介します。
Highlights
- 00:09 1. Jalviewについて
- 00:22 2. ClustalWを使ってアラインメントする
- 01:20 3. Jalviewのダウンロード
- 02:36 4. アラインメント結果の表示
- 03:33 5. 系統樹の作成
- 04:12 6. 配列の削除と系統樹の再計算
- 04:44 7. 配列の追加と新しい系統樹の作成
- 06:30 8. 系統樹の画像を保存する
- 07:06 9. JalviewJSについて
- 08:03 10. アプリケーション版と異なる点
Download the video file
220520_Jalview.mov