CentroidFold はゲノム情報研究センター (CBRC) などが提供する RNA 2次構造予測ツールです。CentroidFold を使えば RNA のプライマーやプローブ、siRNA や miRNA が結合するサイトの特定や2次構造の有無を調べることができます。400nt 以下の RNA 配列の2次構造を予測することができます。今回はサンプルとして提供されているリボザイムの配列を使用して基本的な使用方法とオプションについて解説します。