バイオインフォマティクスツール･パッケージを自作する
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Juliaのパッケージ開発2022年版 @ Bio”Pack”athon2022#2
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この動画が再生されない場合は、YouTubeでご覧ください。https://youtu.be/qRTJjftjPaQ
Juliaのパッケージ開発2022年版 @ Bio”Pack”athon2022#2
2022年2月9日に開催された、Bio"Pack"athon 2022 #2の佐藤 建太氏による「Juliaのパッケージ開発 2022年版」をお送りします。
本講習では、Julia言語によるパッケージ開発の仕方を紹介しています。Juliaは高速かつ手軽に使えるプログラミング言語で、科学技術計算などに使われています。Juliaのパッケージ開発だけでなく、GitHub Actionsと連携して開発自動化する方法についてもお話しされています。また、ご講演いただいた佐藤氏の著書である「1から始める Juliaプログラミング」も合わせてご覧になられると、よりいっそう理解が深まります。
この講演動画は、Bio”Pack”athon（バイオパッカソン）からご寄託いただきました。
Bio”Pack”athonでは、以下のような活動をしています。
- ・パッケージ開発に関するミートアップ(月一開催)
- ・日本語によるパッケージング教材の拡充化
- ・Bioconductorへの登録サポート
- ・BioC Asia 2021の開催
Highlights
- 01:01 1. 想定しているJuliaの実行環境
- 02:24 2. Juliaのパッケージとは何か？
- 03:54 3. パッケージのディクレクトリ構造
- 07:13 4. パッケージ公開までの道のり
- 07:50 5. パッケージの雛形を作成するには?
- 11:55 6. パッケージの管理には何を使うのか?
- 14:15 7. パッケージ環境情報はどこに保存されるのか?
- 19:15 8. パッケージ環境切り替えTips
- 21:20 9. パッケージ開発時のソースコードファイルの扱い方
- 24:07 10. 依存パッケージはどうやって追加するのか?
- 26:54 11. パッケージ開発時のテストの仕方
- 31:03 12. ドキュメントの書き方
- 38:05 13. GitHub Actionsによる開発自動化
- 42:45 14. パッケージをリリースするには?
- 47:07 15. まとめ
- 48:53 16. 質問タイム
- 49:05 17. 同じパッケージ環境を再現するには何を共有すればよいか?
- 55:32 18. JuliaのREPL切り替えショートカット
- 58:03 19. 「1から始める Juliaプログラミング」に書かれていないトピックはあるか?
Download the video file
220421_sato_julia.mov