Ensembl BioMartは、Ensembl Genome Browser(European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI)(欧州バイオインフォマティクス研究所) で開発、維持されているゲノムブラウザ、ゲノムアノテーション閲覧システム)の機能の一つで、 Ensembl で提供されているゲノムアノテーションを網羅的に取得したり、様々な条件で絞り込んで取得することができます。遺伝子機能情報だけでなく、塩基配列を取得したり、オーソログ情報を活用して生物種間のID対応表を作成することができるなど多くの場面で活用することができます。検索結果と同時に発行されるXMLファイルを使えば、ウェブページを経由せずプログラマティックにデータを取得することもできます。