本日の統合TVは、2021年7月15日に開催された統合データベース講習会:AJACSオンライン7から、広島大学/ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS) 坊農 秀雅 氏 による「ゲノムデータベース/ゲノムブラウザを使って配列解析と遺伝子機能解析を行う」をお送りします。
本講習では、ゲノムデータベースとゲノムブラウザを使って配列解析や遺伝子機能解析ができるようになることを目的として、NCBI Genome Data Viewer、UCSC Genome Browser、Ensembl Genome Browser等の各種ゲノムブラウザを概説するとともに、塩基配列データベースとしてDDBJ/EMBL/GenBank、Sequence Read Archive (SRA)、RefSeqなどを紹介しています。また、配列解析入門としてBLASTの概説やBLATについても紹介しています。