Table Browserは、米国カリフォルニア大学サンタクルーズ校 (UCSC) が開発しているUCSC Genome Browserの中のコンテンツの一つで、UCSC Genome Browserで閲覧可能な多様なアノテーショントラックからデータの属性に基づいてフィルターをかけたり、別のトラックのデータとの結合による交点を取得するなど、欲しいデータだけに絞り込んで閲覧し取得することができるサービスです。
今回の動画では、Table Browserを用いる例として2つの方法を紹介します。1つ目は、ENCODE Regulation TF Clusters Track のデータからエストロゲン受容体(ESR1)の結合サイトのみを選択し、次に、sno/miRNA Trackのデータからnon coding RNAであるsno/miRNAの遺伝子コード領域と重なるものだけを抽出したあとで、そのゲノム上の領域をUCSC Genome Browserで閲覧する方法です。2つ目は、NCBI RefSeq Trackのデータを染色体の位置で絞り込み、その全件を様々なフォーマットで取得する方法について説明します。