バイオインフォマティクスツール･パッケージを自作する
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この動画が再生されない場合は、YouTubeでご覧ください。https://youtu.be/N5dajDE61gc
Bioconductorにおけるtidyなデータ解析の最新動向 @ Bio”Pack”athon2020#11
2020年11月11日に開催された、BioPackathon2020#11の露崎 弘毅 氏による 「Bioconductorにおけるtidyなデータ解析の最新動向」をお送りします。約49分です。
本講習では、前半ではtidyverse入門について、後半ではtidyなデータ解析に対しての見解について紹介しています。tidyverseとは、データのモデル化、変換、視覚化といった機能を提供するデータサイエンスのために設計されたRパッケージ集で、すべてのパッケージは、基本的な設計思想、文法、データ構造を共有しています。
この講演動画は、Bio”Pack”athon（バイオパッカソン）からご寄託いただきました。
Bio”Pack”athonでは、以下のような活動をしています。
- ・パッケージ開発に関するミートアップ(月一開催)
- ・日本語によるパッケージング教材の拡充化
- ・Bioconductorへの登録サポート
- ・BioC Asia 2021への準備と誘致
Highlights
- 00:29 1. Rの様々なコーディングスタイル
- 06:18 2. tidyverseの流儀に従っておくと便利なこと
- 07:45 3. tidy dataとは
- 12:26 4. tidyverseの内訳
- 17:51 5. tidyverse利用のデメリット (私見)
- 21:04 6. Bioconductorのtidy化
- 23:34 7. tidyverse × データ解析
- 24:13 8. 教師あり学習モデルの例
- 31:08 9. 教師なし学習モデルの例
- 36:23 10. tidySummarizedExperimentについて
- 37:35 11. tidybulkについて
- 38:29 12. tidySingleCellExperiment/tidySeuratについて
- 39:12 13. まとめ・Q&A
Download the video file
210214_tidydata.mov