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化合物データベース (代謝DBを中心に、KEGGやHMDBなど) ＠ AJACSオンライン4
本日の統合TVは、2020年12月9日に開催された統合データベース講習会:AJACSオンライン4から、理化学研究所 環境資源科学研究センター メタボローム情報研究チーム 津川 裕司 氏 による「化合物データベース (代謝DBを中心に、KEGGやHMDBなど)」をお送りします。約45分です。
本講習では、メタボローム解析を行う際、どこにいけば必要な情報が手に入るか？を知ることを目標として、化合物や代謝に関するデータベース(主にKEGGやHuman Metabolome Database (HMDB))を中心に紹介しています。
講習会の一連の動画はYouTubeの再生リストからもご覧いただけます。
本講習では、メタボローム解析を行う際、どこにいけば必要な情報が手に入るか？を知ることを目標として、化合物や代謝に関するデータベース(主にKEGGやHuman Metabolome Database (HMDB))を中心に紹介しています。
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Highlights
- 00:14 1. 初めに
- 04:13 2. メタボロームデータを使う側(化合物IDの取得、データベース検索、代謝マップ投影、オミクスモジュールへ統合)
- 27:21 3. メタボロームデータを出す側(質量分析、マススペクトル、質量分析インフォマティクス、アノテーション)
- 44:12 4. 参考Webサイト：メタボロミクス若手会(ESI友の会)
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210107_AJACSonline4_01_tsugawa.mov