塩基配列解析のためのデータベース・ウェブツール @ AJACSオンライン2

本日の統合TVは、2020年10月14日に開催された統合データベース講習会:AJACSオンライン2から、ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS) 内藤 雄樹 による「塩基配列解析のためのデータベース・ウェブツール」をお送りします。約55分です。なお、オンライン配信時の機材不調により講師の映像と音ズレが発生していますが、進行には問題ありません。
本講習では、主にNCBI データベースNCBI BLASTUCSC BLATUCSCゲノムブラウザの基本的な使い方について紹介しています。
また、塩基配列検索に関連する有用サイトとして、統合遺伝子検索GGRNA高速配列検索GGGenomesiRNA設計ウェブサーバsiDirectCRISPR設計ウェブサーバCRISPRdirectの使い方についても活用例を交えながら紹介しています。
講習会の一連の動画はYouTubeの再生リストからもご覧いただけます。

Highlights

  • 03:56 1. 遺伝子を探す
  • 29:10 2. 統合遺伝子検索GGRNA
  • 38:34 3. 超絶高速ゲノム配列検索GGGenome
  • 47:39 4. CRISPR-Cas9のガイドRNA設計

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201125_AJACSonline2_01_naito.mov

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