微生物統合データベースMicrobeDB.jpの活用法 @ AJACS世田谷

本日の統合TVは、2019年11月29日に開催された統合データベース講習会:AJACS世田谷から、国立遺伝学研究所 森 宙史 氏 による「微生物統合データベースMicrobeDB.jpの活用法」をお送りします。約53分です。
目標:公共の微生物のゲノム・メタゲノム解析データ等をMicrobeDB.jpで検索する方法、および、VITCOMIC2、LEA等を用いて、自分の持つマイクロバイオームのアンプリコンシーケンスデータやメタゲノムシーケンスデータから系統組成を推定し、系統組成が似たMicrobeDB.jp上のメタゲノム解析データを検索する方法がわかる。
この動画と講習資料が同時に見られる「講習会 実習資料(AJACS)」ページはこちらです。
講習会の一連の動画はYouTubeの再生リストからもご覧いただけます。

Highlights

  • 00:40 1.MicrobeDBの概要
  • 15:55 2.メタゲノム解析の情報解析手法について
  • 35:52 3.MicrobeDB.jpの使い方

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200116_AJACS80_04_mori.mov

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